“言过其实”的生物医学技术突破——ENCODE
北京待明(多言數窮不如守中)
上海 2012年9月6日电 /生物谷BIOON/ --9月5日,国际科学界宣布,“DNA元素百科全书”计划(简称ENCODE)获得了迄今最详细的人类基因组分析数据,由于其成果非常复杂,以30余篇论文的形式同时发表在Nature,Science,Genome Research,Genome Biology杂志等一系列学术期刊上,文章作者就达442位,迅速成为各大媒体和生物科学界热议的话题。生物谷就相关问题采访了ENCODE项目的参与者之一,美国某实验室做博士后研究的华人研究人员李青(化名)。 人类基因组计划与ENCODE ENCODE被认为是“人类基因组计划”之后国际科学界在基因研究领域取得的又一重大进展。人类基因组计划让我们得到了人类基因组图谱,但其中许多基因过去都不知道有什么功能。研究者最常关注的是与编码蛋白质相关的基因,但它们只占整个基因组的约2%。一个聚集了422位科学家的国际团队,完成了解析基因组剩余部分(非编码区域)的工作,人类基因组中约80%的基因都有某种确定的功能。 最近,阶段参与了ENCODE项目的英国桑格研究所研究人员珍妮弗·哈罗公开说,如果说人类基因组计划提供了一张地图,那么ENCODE计划就在这张地图上标出了各个基因的功能信息。 这两个计划之间具有承上启下的关系,在人类基因组计划基本完成的2003年,国际科学界创建了ENCODE计划。它也是一个大型国际合作项目,有多个国家和地区的32个研究机构参与。 ENCODE项目华人研究者的声音 李青的观点似乎更谨慎些,“在基因组时代,数据是一切研究的基础,而数据产出的本身需要大量资源支持,包括专业人员和经费的投入。在NIH资助下,ENCODE项目提供一个平台,集中了包括实验科学家和专业的数据分析人员在内的众多优秀科学家,在一个大的框架里合理调配和使用研究资源,最终的产出的确建立了一个Non-coding DNA的研究蓝图。” “大家都知道这个项目花了很多钱,基本是认准了一个方向,很多高端实验室一起上。从实验室的角度来说,得到了几年的稳定资金支持,可以大规模的产出数据并分析,从国家的角度来说,对Non-coding RNA的功能研究会起到了巨大的推动作用,”李青在接受生物谷采访时补充到,“ENCODE具体科学意义不好多谈,毕竟它囊括的具体方向太多,有媒体将其宣传为‘本世纪生物医学领域最大突破’有点言过其实。” 关于ENCODE项目的意义 另据一位预计年内上市的相关行业高层分析,ENCODE项目从短期看利于测序产业,因为基因组会成为更热的研究方向,从长期来看影响深远,对疾病诊断、药物研发等都会具有推动作用,新增市场价值当以万亿美元计算。(生物谷 Bioon.com)
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