《化石：洪荒时代的印记》一些杂乱的笔记
化石是史前动植物保留下来的遗存，通常是灭绝生物有机体中不易腐烂的坚硬部分，被封闭保存在沉积物里，并最终被埋藏在岩石之中。化石也可以是保存在岩石中的动物行为记录，比如脚印，或者身体部分难以保存的软体动物行为时遗留下来的潜穴或痕迹。
英国的雷(John Ray,1627-1705)，法国的布丰(George Buffon,1707-1788)和瑞典的林奈(Carl von Linne,1707-1778)，这三位学者的工作构建出了现在我们依然使用的生物分类框架。他们最卓越的贡献在于，将各类动植物划分到“种”这个基本的分类单元。林奈创造出了我们今天仍遵循的生物层级分类规则，而从某种程度上讲，命名一个物种成为了认识它的必经步骤；这也创造出一种世界通用的语言：从此全世界的科学家只要使用经科学方法命名的学名，便知道他们在讨论同一种动物或植物。
当沉积物在某处沉积下来后变得越发致密，其中的水分渐渐流失，并发生一系列微妙的化学变化，最终形成页岩、砂岩、灰岩等沉积岩。在灰岩等较为坚硬的沉积岩中，化石常常可以保持原来的形状和立体感，然而页岩在形成的过程中会被压缩，因此其中保存的化石也会被压扁。有时相同物种的化石因保存围岩的硬度差别，外观截然不同。
许多物种的化石材料都十分破碎，经过许多年的时间才能找到新的材料，甚至永远也找不到。如同现代生物界不同物种有繁盛与稀少的差别一样，化石物种也有同样的分别。有些物种的化石数量非常巨大，只要地层找对，地质锤所敲之处，俯拾皆是；有些物种的化石则极为稀少，一个采集者可能某天在某个采石场发现了一个标本，而此后数年再去同一个地点都没法找到第二件。这也正是古生物学的魅力所在：我们无法完全预见将会发生什么。
如同莱伊尔所言，整个地史时期的物理动力都是相同的，所以地球逐渐变化的过程是可以被探知的。不变的物理法则所影响的是一个不断变化的地球，海陆变迁多次发生。几亿年来，地球上的生命也始终与环境保持着和谐的关系，并在这个过程中发生着持续不断的演变。
最初的四个纪（寒武纪、奥陶纪、志留纪和泥盆纪）都是以英国地点的名称命名的：寒武纪(Cambrian)来自威尔士的拉丁文写法；奥陶纪(Ordovician)和志留纪(Silurian)来自两个古老的威尔士部族，泥盆纪(Devonian)源于英格兰的德文郡(Devon)。注：这四个纪的中文名称则来自日语汉字的音译。
石炭纪(Carboniferous)因岩层内包含了丰富的煤炭层而得名，二叠纪(Permian)则来自于俄罗斯彼尔母山(Perm mountains)的典型岩层。三叠纪(Trisssic)在德国的岩层可以根据其自然特征划分为三个单元，侏罗纪的命名在前文已经提到（根据侏罗山命名）。白垩纪(Cretaceous)的岩层含有纯白色灰岩，被称为白垩岩(chalk，拉丁文为creta)。比“纪”(period)更高一级的地质时代单位是”代“(era)，用途也很广，地球历史中有三个主要的含化石时期：古生代（Palaeozoic，意为”古老的生命“，包括从寒武纪到二叠纪），中生代（Mesozoic，意为”中间的生命“，从三叠纪到白垩纪）和新生代（Cenozoic，意为”新的生命“，包括古近纪——新近纪和第四纪）。
海绵(sponge)是一个重要的多细胞生物类群，它的细胞都有特定的功能，并松散地聚合在一起。一些海绵在遭到破坏后具有重新“构建”其细胞群体的能力。并非所有的海绵都还有可以石化的坚硬部分。那些坚硬的骨制结构十分细小，呈分枝状，被称为骨针。这些骨针可能只是松散地连接在海绵组织中，也可能或多或少地融合在一起构成坚硬的骨骼。
